La préparation à l'université, aux carrières (et au-delà) nécessite une étude approfondie des arts de la langue anglaise, des études sociales, des mathématiques et des sciences. Les étudiants de la New York Harbor School suivent des cours basés sur Regents dans tous les domaines de contenu de base et des cours supplémentaires en langues étrangères, en arts, en éducation physique et en santé.